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用“分子机械臂”给药物“换房梁”

发布时间:2026-05-07 分类:finance 来源:中国科学报


曾会应(左一)与团队成员在实验室。

■本报记者 叶满山

“你知道吗?我们常用的降压药利血平、非甾体抗炎药吲哚美辛、治疗偏头痛的舒马曲坦,甚至抗癌药物长春新碱,这些看似毫无关联的药物,都藏着一个共同的‘分子密码’——吲哚骨架。”在兰州大学天然产物化学全国重点实验室的会议室里,曾会应教授拿起一支笔,在白板上画下一个由六边形和五边形组成的环状结构。“这个像‘云朵’一样的分子结构,是70多种临床药物的核心骨架,也是我们团队钻研6年的‘老朋友’。”

近日,曾会应带领团队与加拿大麦吉尔大学教授李朝军合作,开发出一种面向吲哚分子的精准骨架编辑新策略——不仅能像“换房梁”一样替换吲哚骨架上的关键碳原子,还能同步完成“精装修”,为药物研发和天然产物合成开辟了新路径。相关论文发表于《科学》。

“云朵”骨架里的大文章

在有机化学的世界里,吲哚骨架有着“明星分子”的地位。它由一个苯环(六边形)和一个含氮的吡咯环(五边形)稠合而成,因结构酷似天空中的云朵,被曾会应团队亲切地称为“分子云朵”。

“别看结构简单,它的生物活性却非常丰富。”曾会应解释道,吲哚骨架广泛存在于天然产物、药物分子和生物活性分子中,从植物中的生物碱到人体内的神经递质血清素,都有它的身影。

据统计,全球临床使用的药物中,超过70种具有吲哚结构。但传统分子修饰方法,大多只能在吲哚骨架的“外围”做文章,如添加一些化学基团,就像给房子刷油漆、装窗帘,却无法改变房子的核心梁柱。

“如果发现药物的‘骨架’有问题,如活性不够、副作用大,传统方法只能推倒重来,不仅耗时耗力,还会大幅增加研发成本。”曾会应说,这正是团队多年来想要突破的瓶颈。

2020年,曾会应团队正式启动吲哚骨架编辑研究。彼时,全球分子骨架编辑研究刚刚起步,大多集中在原子插入或删除,还没有人能实现吲哚骨架关键位点的精准置换,更别提同步引入功能基团了。“我们当时就想,能不能找到一种方法,既不破坏吲哚的核心结构,又能精准改造它的关键部位,让‘老骨架’焕发‘新活力’。”曾会应说。

从30%到96%:一支LED灯照亮科研之路

“一开始,产率只有30%,副产物还无法确定,我每天在实验室重复实验,却看不到希望。”论文共同第一作者、兰州大学博士研究生张铃想起最初的研究,依然历历在目。这位来自贵州的女孩,从本科阶段就加入曾会应课题组,整整5年时间,她的科研生活几乎都在围着吲哚骨架转。

张铃记得,刚接手项目时,师姐留下的实验数据显示,反应产率最高只有30%。“30%的产率意味着大部分原料都浪费了,这样的方法根本没有实用价值。”张铃说,那段时间,她每天要做十几个实验,尝试不同的添加剂、溶剂、反应温度和光的波长,却始终无法突破产率瓶颈。

每当张铃感到迷茫时,曾会应总会耐心开导:“科研路上遇到困难是常态,重要的是找到问题关键。”团队成员也没有放弃,他们一起查阅文献、讨论机理,几乎试遍了实验室里能用的试剂。在一次偶然尝试中,转机出现了。团队发现,反应的关键可能在于某种光源。

“我们当时用的是常见的紫外灯(254nm和365nm)和蓝光灯(405nm),产率一直上不去。有一天,我突然想到,会不会是波长不合适。”曾会应说,团队随后采购了不同波长的LED灯,从254nm到425nm逐一测试。当他们换上280nm的LED灯时,奇迹发生了——反应产率从30%一下子提升到80%以上,部分底物产率甚至达到96%。

“那是我最开心的一天!”张铃兴奋地说,“我们用的就是市面上能买到的普通LED灯,没想到这么一个小小的改变,竟然解决了困扰我们一年多的难题。”更让团队惊喜的是,这种方法不仅产率高,还具备良好的底物兼容性——无论是带有供电子基团、吸电子基团的底物,还是空间位阻较大的底物,都能顺利反应。

但新的挑战接踵而至:反应机理是什么?

“我们知道反应能成功,但不知道具体反应过程是怎么发生的。”曾会应说,为弄清楚反应的“来龙去脉”,团队又花了近一年时间。他们通过同位素标记实验,用碳-13标记关键碳原子去向,还分离出反应中间体,结合密度泛函理论(DFT)计算,终于揭开了反应的神秘面纱。

原来,团队巧妙利用天然色胺侧链的结构特点,将其设计成“分子机械臂”。在280nm LED灯的照射下,这个“机械臂”会像吊塔一样,将需要置换的碳原子“抓”到指定位置,同时将新的功能基团“送”上去,同步实现“单碳置换”与“位点功能化”。“这就像给房子换梁时,顺便把装修做好,既节省时间,又提高效率。”曾会应比喻道。

4步合成的“奇迹”:从实验室走向药物研发

“如果说产率突破是重要一步,那么将方法用于天然产物全合成或药物分子构建,才是检验真正合成价值的关键一步。”曾会应说,为验证方法的实用性,团队将目光投向一种结构复杂的四环天然产物——单萜吲哚生物碱白坚木胺。此前全球最短的合成路线需要9步,总收率较低。

“我们想,能不能用新方法缩短合成路线、提高合成效率。”曾会应说,2023年的一天,他在回家的路上突然想到一个思路:先做一个简单的模型底物验证可行性。曾会应立刻联系张铃,让她尝试合成环己酰胺底物。“我当时还挺紧张的,怕做不出来。”张铃说,没想到实验非常顺利,环己酰胺底物的反应效果很好。

有了模型底物的成功经验,团队信心大增,开始向白坚木胺全合成发起冲击。张铃从简单的化工原料丁醛出发,一步步构建分子结构。“最关键的一步就是我们的骨架编辑反应,‘分子机械臂’一下子就构建出白坚木胺的核心骨架。”张铃说,最终,团队仅用4步就完了白坚木胺全合成,创下最短合成路线纪录,并大幅提高总收率。

“这个结果让我们非常振奋!”曾会应说,这意味着该方法不仅在理论上具有创新意义,还能真正应用到复杂分子的合成中,为天然产物全合成提供了新思路。更重要的是,它还能用于药物分子的后期修饰——通过精准改造吲哚骨架,快速优化药物的活性,降低研发成本。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1126/science.aec3587


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